scRNA-seq与显微切割技术相结合，已成为空间转录组分析的重要工具。然而，对于单细胞分辨率样本，因高昂的实验成本和繁琐的操作流程，使得这种方法难以满足不断提高的实验通量。为此，我们提出了Combinational DNA Barcode（CDB）-seq，结合Smart-3SEQ和CDB磁性微球进行中低通量空间转录分析。本文全面比较了CDB磁珠的制备条件和相关因素，并将CDB-seq应用于RNA提取液，FF和FFPE小鼠脑组织样本，CDB-seq能以一种简单、经济高效的方式获得数十个显微解剖样本的转录组图谱，为未来的空间转录组学研究提供了一种前景广阔的方法。