郝洁 - 上海交通大学 - 系统生物医学研究院

个人简介

学习经历 2002年9月- 2004年7月: 英国伯明翰大学，电子电机工程学院本硕连读（MEng），电子电机工程专业，一等荣誉学位，建系以来年级最高分奖获得者（唯一），年级最佳毕业设计奖获得者（唯一） 2002年9月- 2004年7月: 管理学4级学位，英国特许管理学会Chartered Management Institute (CMI) 2005年12月- 2010年11月:英国伯明翰大学，生物医学信息博士学位工作经历 2015年5月-今：上海交通大学，生物医学信息学，副研究员 2016年6月-今荣誉博士后, 英国帝国理工大学, 医学院， 2010年10月-2015年2月：英国帝国理工大学，计算与系统医学部，博士后

研究领域

从事机器学习，生物信息学，化学计量学，多变量统计分析等在代谢组学等多组学领域的应用，以及算法和软件的研发。研究方向包括核磁共振波谱对儿童脑瘤的分析，环境污染监测，机器学习，模式识别，数据挖掘，生物信息学，化学计量学，多变量统计学，和代谢组学分析。

近期论文

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Jie Hao, Wei Cao, Jian Huang, Xin Zou*, Ze-Guang Han*，2019, Optimal Gene Filtering for Single-Cell data (OGFSC) – a gene filtering algorithm for single-cell RNA-seq data, Bioinformatics, in press. Hao J, Liebeke M, Sommer U, Viant MR，Bundy JG Ebbels T，2016， Statistical correlations between NMR spectroscopy and direct infusion FT-ICR mass spectrometry aid annotation of unknowns in metabolomics. Analytical Chemistry，88:2583-2589. Hao J, Liebeke M, Astle W, De Iorio M, Bundy JG, Ebbels T, 2014, Bayesian Deconvolution and Quantitation of Metabolites in Complex 1D NMR Spectra Using BATMAN, Nature Protocols, Vol:9, ISSN:1754-2189, Pages:1416-1427. Liebeke M, Hao J, Ebbels TM, Bundy JG, 2013, Combining Spectral Ordering with Peak Fitting for One-Dimensional NMR Quantitative Metabolomics, Analytical Chemistry, 85, 0003-2700. Hao J, Astle W, De Iorio M, Ebbels T, 2012, BATMAN—an R package for the automated quantification of metabolites from NMR spectra using a Bayesian Model. Bioinformatics, 28(15): 2088-90. Hao J, Zou X, Wilson M, Davies NP, Sun Y, Peet AC, Arvanitis TN, 2012, A Hybrid Method of Applying Independent Component Analysis on in vivo 1H Magnetic Resonance Spectra of Childhood Brain Tumours, NMR in Biomedicine, 25: 594–606. Hao J, Zou X, Wilson MP, Davies NP, Sun Y, Peet AC, Arvanitis TN, 2009, A comparative study of feature extraction and blind source separation of independent component analysis (ICA) on childhood brain tumour 1H magnetic resonance spectra, NMR in Biomedicine, 22(8):809-818.