国宏哲 - 哈尔滨工业大学

个人简介

国宏哲，哈工大计算学部讲师、硕士生导师，黑龙江省头雁计划成员。主要研究方向：测序数据分析、序列比对与拼接、基因组变异检测、单细胞数据分析、生物大数据安全。在Journal of Infection（IF=38.637）Bioinformatics（IF=6.937）、BMC Bioinformatics（IF=3.307）等生物信息学顶级期刊发表多篇学术论文。主持国家自然科学基金青年项目一项、中国博士后科学基金面上项目一项。目前担任BMC Bioinformatics、IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics、Frontiers in Genetics等生物信息学期刊审稿人，黑龙江省计算机学会数据科学与大数据技术专业委员会。教育经历 2006.09 – 2010.07 生物信息技术哈尔滨工业大学学士 2010.09 – 2012.07 计算机科学与技术哈尔滨工业大学硕士 2012.09 – 2019.04 计算机应用技术哈尔滨工业大学博士 2013.09 – 2014.12 美国杜克大学生物信息学联合培养博士工作经历星云生物信息技术开发有限公司高级算法工程师 2019.05 – 2020.08 哈尔滨工业大学计算学部师资博士后讲师 2020.10 至今

研究领域

生物信息学大规模基因组测序数据分析算法研究

近期论文

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Hongzhe Guo, and Zhao, Tianyi. Multiple mutations of IFITM3 are associated with COVID-19 susceptibility. Journal of Infection, 10.1016/j.jinf.2023.02.032, 2023. （IF：38.637；中科院一区期刊） Hongzhe Guo#, Zhongbo Yang#, Tao Jiang, Shiqi Liu, Yadong Wang* and Zhe Cui*, Evaluation of classification in single cell atac-seq data with machine learning methods, BMC Bioinformatics, 23(5):249-259, 2022.（IF：3.307；中科院二区期刊） Hongzhe Guo#, Yilei Fu, Yan Gao, Junyi Li, Yadong Wang* and Bo Liu*, deGSM: memory scalable construction of large scale de Bruijn Graph, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 18(6):2157-2166, 2021.（IF：3.016；中科院二区期刊；CCF B类期刊） Ping Meng#, Guohua Wang, Hongzhe Guo* and Tao Jiang*, Identifying cancer driver genes using a two-stage random walk with restart on a gene interaction network, Computers in Biology and Medicine, 158(1):106810, 2023. （IF：7.7；中科院一区期刊） Tao Jiang#, Shiqi Liu#, Shuqi Cao, Yadong Liu, Zhe Cui, Yadong Wang* and Hongzhe Guo*, Long-read sequencing settings for efficient structural variation detection based on the comprehensive evaluation, BMC Bioinformatics, 22(1): 552-568, 2021.（通讯作者，IF：3.307；中科院二区期刊） Tao Jiang#, Shiqi Liu and Hongzhe Guo*. Reply: Correspondence on NanoVar’s performance outlined by Jiang T. et al. in ‘Long-read sequencing settings for efficient structural variation detection based on comprehensive evaluation, BMC Bioinformatics 24, 352 (2023).（通讯作者，IF：3.307；中科院二区期刊）闫贞磊#, 国宏哲*, 面向大规模人群的基因组注释系统. Chinese Journal of Bioinformatics, 20(1), 2022.（通讯作者，全国中文核心期刊） Hongzhe Guo#, Bo Liu#, Dengfeng Guan, Yilei Fu and Yadong Wang*, Fast read alignment with incorporation of known genomic variants. BMC Medical Informatics and Decision Making, 2019, 19(6): 1-13.（IF：3.176；中科院三区期刊） Hongzhe Guo#, Bo Liu, Dengfeng Guan, Yilei Fu and Yadong Wang*, Fast variation-aware read alignment with deBGA-VARA, 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Madrid, 2018-12-3至2018-12-6. (CCF B类会议) Bo Liu#, Hongzhe Guo#, Michael Brudno and Yadong Wang*, deBGA: read alignment with de Bruijn graph-based seed and extension, Bioinformatics, 2016, 32(21): 3224-3232. （共同一作；IF：6.937；中科院一区期刊）