靳文菲 - 南方科技大学

个人简介

工作经历 2017年– 至今南方科技大学生物系副教授 2013年– 2017年美国国立卫生研究院 (NIH) 博士后研究员合作导师：赵可吉博士 2011年– 2012年中科院上海生科院助理研究员学习经历 2006年- 2012年中科院上海生科院计算生物学博士导师: 金力院士和徐书华研究员 2006年- 2006年中科院上海生科院生化细胞所毕业实习指导老师: 刘默芳研究员和王恩多院士 2001年- 2006年郑州大学本科

研究领域

发展单细胞表观遗传学测序技术研究生物发育和组织病变；利用全基因组测序数据鉴定癌症的遗传突变和表观遗传变化，揭示发病机理；利用多种组学数据建立疾病风险模型，预测疾病风险和最佳治疗方案，为精准医疗提供指导

近期论文

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[1] Jin W, Tang Q, Wangsa D, Cui K, Ried T and Zhao K. TrAC-looping reveals extensive reorganization of enhancer-promoter interaction during T cell activation. Cell (Under review) [2] Ren G#, Jin W#, Cui K#, Rodrigez J, Larson D and Zhao K. 2017 CTCF-mediated enhancer-promoter interaction is a critical regulator of cell-to-cell variation of gene expression. Mol Cell. (In press) [3] Jin W#, Tang Q#, Wan M, Cui K, Zhang Y, Ren G, Ni B, Sklar J, Przytycka T, Childs R, Levens D, Zhao K. 2015. Genome-wide detection of DNase I hypersensitive sites in single cells and FFPE tissue samples. Nature. 528:142-146 [4] Kraushaar DC#, Jin W#, Maunakea A, Abraham B, Ha M, Zhao K. 2013. Genome-wide incorporation dynamics reveal distinct categories of turnover for the histone variant H3.3. Genome Biol. 14:R121. [5] Jin W#, Li R#, Zhou Y, Xu S. 2014. Distribution of ancestral chromosomal segments in admixed genomes and its implications for inferring population history and admixture mapping. Euro J Hum Genet. 22:930-937. [6] Wang E#, Jin W#, Duan W#, Qiao B, Sun S, Huang G, Shi K, Jin L, Wang H. 2013. Association of two variants in SMAD7 with the risk of congenital heart disease in the Han Chinese population. PloS ONE. 8:e72423. [7] Jin W, Xu S, Wang H, Yu Y, Shen Y, Wu B, Jin L. 2012. Genome-wide detection of natural selection in African Americans pre- and post-admixture. Genome Res. 22:519-527. [8] Jin W, Wang S, Wang H, Jin L, Xu S. 2012. Exploring population admixture dynamics via empirical and simulated genome-wide distribution of ancestral chromosomal segments. Am J Hum Genet. 91:849-862. [9] Jin W, Qin P, Lou H, Jin L, Xu S. 2012. A systematic characterization of genes underlying both complex and Mendelian diseases. Hum Mol Genet. 21: 1611-1624. [10] Xu S, Jin W, Jin L. 2009. Haplotype sharing analysis showing Uyghurs are unlikely genetic donors. Mol Biol Evol. 26: 2197-2206.