研究领域
主要从事色谱基本理论和新技术、新方法的研究，为我国色谱学科的发展作出了巨大的贡献。在基础研究方面，采用统计热力学的方法研究溶质在多种色谱分离模式下的保留行为，推导出物理意义明确的描述流动相组成对色谱保留值影响的理论表达式，阐明了色谱过程中影响分离行为的分子结构因素，从而建立了系统的色谱热力学研究方法，也为液相色谱专家系统的建立奠定了理论基础；采用物料平衡原理建立了包括柱外效应影响的溶质在整个色谱分离系统中输运的质量平衡模型，对色谱流出曲线高阶统计矩的研究，从理论上阐明了影响色谱峰展宽和峰形对称性的动力学因素，证实了保留时间与半峰宽之间存在的定量关系。采用高斯卷积模型对色谱流出曲线进行拟合，发现了模型参数与色谱操作条件之间的定量关系，从而解决了色谱图的存储和重叠峰定量解析等难题；在建立液相色谱专家系统总体布局过程中，针对国外只考虑经验规律的片面性,首次提出了“知识库必须基于色谱理论和经验规律相结合”的思想，据此思想建立的知识库已用于液相色谱柱系统推荐，并以大量的事实验证了知识库的正确性和可靠性。将串联优化指标与智能搜索方法相结合建立了智能优化方法，并用于复杂样品的分离条件优化；在毛细管电泳的理论研究中，发现了毛细管区带电泳中操作参数及溶质的分子结构对迁移行为的影响规律。
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张玉奎 等编著，现代生物样品分离分析方法，科学出版社, ISBN 7-03-011117-6, (2003)
Junfeng Ma, Jinxiang Liu, Liangliang Sun, Liang Gao, Zhen Liang, Lihua Zhang, Yukui Zhang, On-line Integrating Multiple Sample Pretreatment Steps Involving Denaturation, Reduction, and Digestion with μRPLC-ESI-MS/MS for High-Throughput Proteome Profiling, Anal. Chem., in press，2009
Dingyin Tao, Guijie Zhu, Liangliang Sun, Junfeng Ma, Zhen Liang, Weibing Zhang, Lihua Zhang, Yukui Zhang, Serially coupled microcolumn reversed phase liquid chromatography for shotgun proteomic analysis, Proteomics, 2009，9, 2029-2036
Junfeng Ma, Zhen Liang, Qiliang Deng, Xiaoqiang Qiao, Dingyin Tao, Lihua Zhang, Yukkui Zhang, Organic-Inorganic Hybrid Silica Monolith Based Immobilized Trypsin Reactor with High Enzymatic Activity, Anal. Chem., 2008，80, 2049-2056
Jicheng Duan, Zhen Liang, Chun Yang, Jie Zhang, Lihua Zhang, Weibing Zhang, Yukui Zhang, Rapid protein identification using monolithic enzymatic microreactor and LC-ESI-MS/MS, Proteomics,2006，6, 412-419 "
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