个人简介

学习经历 2011.09-2015.07南京农业大学园艺学院(博士) 2009.09-2011.07南京农业大学园艺学院(硕士) 2005.09-2009.07河北科技师范学院园艺园林系(学士) 工作经历 2015.07-至今，华北理工大学生命科学学院生物信息系任职工作。 教学及指导研究生情况 主要讲授分子进化分析、生物数据分析、生物进化论、植物学和基因组学等课程，并指导本科和研究生相关的毕业设计及科研课题。

研究领域

研究方向为基因组学及生物信息学。主要从事比较基因组和功能基因组学研究，包括基因家族分析、全基因组关联分析和物种进化分析等。 1.十字花科作物基因组测序及重测序分析。对十字花科相关作物进行基因组测序及重测序，鉴定出了数百万的SNP和大量的结构变异，并对十字花科作物的进化及群体结构进行了系统的研究。 2.全基因组关联分析和基因组选择分析。自主开发并整合已有的软件，对十字花科作物进行全基因组关联和全基因组选择分析，发掘出大量与重要农艺性状相关的SNP位点和候选基因，为进一步的功能验证提供了可靠性极高的候选基因。 3.转录组和表达谱数据分析。挖掘与十字花科作物不同生长发育时期、不同组织及不同逆境胁迫处理下的基因表达模式，并构建LncRNA与mRNA基因的共表达调控网络，为功能基因组学提供丰富的数据资源。 4.基因家族分析。对十字花科和其他重要的植物进行基因家族的研究，揭示基因家族在各个物种进化过程中的进化机制，探究全基因组加倍对基因家族丢失或扩增的影响。构建了基因家族分析流程，为快速的进行基因家族研究提供了便捷条件。 5.组学数据库的搭建。对重要作物的组学数据以及重要的基因家族进行数据库的搭建，为科研人员提供简单、快捷的分析及查询平台。

项目成果 1.“大白菜耐热性LncRNAs的调控网络分析及功能研究”，国家自然科学基金项目，2019.01-2021.12，项目负责人。 2.“甘蓝型油菜基因组比对图谱的构建及Hsf基因家族的进化研究”，河北省高等学校青年拔尖人才计划项目，2018.01-2020.12，项目负责人。 3.“甘蓝BES1转录因子家族的起源、进化及表达分析”，河北省自然科学基金项目，2017.01-2019.12，项目负责人。 4.“甘蓝型油菜AP2/ERF基因家族的进化分析及耐寒关键基因的挖掘”，唐山市科技支撑计划项目，2015.12-2016.12，项目负责人。 5.“十字花科基因组比对图谱的构建及AP2/ERF基因家族的进化分析”，博士科研启动基金项目，2015.12-2018.12，项目负责人。

近期论文

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1.SongX,MaX,LiC,HuJ,YangQ,WangT.,etal.ComprehensiveanalysesoftheBES1genefamilyinBrassicanapusandexaminationoftheirevolutionarypatterninrepresentativespecies.BMCGenomics2018，19:346. 2.WangZ,ZhaoK,PanY,WangJ,SongX,GeW.,etal.Genomic,expressional,protein-proteininteractionalanalysisofTrihelixtranscriptionfactorgenesinSetariaitaliaandinferenceoftheirevolutionarytrajectory.BMCGenomics2018,19:665.(Co-firstauthor). 3.GuoD,SongX,YuanM,WangZ,GeW,WangL,WangJ,WangX.RNA-SeqProfilingShowsDivergentGeneExpressionPatternsinArabidopsisGrownunderDifferentDensities.FrontiersinPlantScience2017,8(2001).(Co-firstauthor). 4.SongX,LiuG,HuangZ,DuanW,TanH,LiY,HouX.TemperatureexpressionpatternsofgenesandtheircoexpressionwithLncRNAsrevealedbyRNA-Seqinnon-headingChinesecabbage.BMCgenomics2016,17:297. 5.SongX,WangJ,MaX,LiY,LeiT,WangL,GeW,GuoD,WangZ,LiC.,etal.Origination,Expansion,EvolutionaryTrajectory,andExpressionBiasofAP2/ERFSuperfamilyinBrassicanapus.Frontiersinplantscience2016,7:1186. 6.SongX,DuanW,HuangZ,LiuG,WuP,LiuT,LiY,HouX.ComprehensiveanalysisofthefloweringgenesinChinesecabbageandexaminationofevolutionarypatternofCO-likegenesinplantkingdom.Scientificreports2015,5:14631. 7.SongX,GeT,LiY,HouX.Genome-wideidentificationofSSRandSNPmarkersfromthenon-headingChinesecabbageforcomparativegenomicanalyses.BMCgenomics2015,16:328. 8.DuanW,SongX,LiuT,HuangZ,RenJ,HouX,DuJ,LiY.Patternsofevolutionaryconservationofascorbicacid-relatedgenesfollowingwhole-genometriplicationinBrassicarapa.Genomebiologyandevolution2015,7(1):299-313.(Co-firstauthor) 9.SongX,LiY,LiuT,DuanW,HuangZ,WangL,TanH,HouX.Genesassociatedwithagronomictraitsinnon-headingChinesecabbageidentifiedbyexpressionprofiling.BMCplantbiology2014,14:71. 10.SongX,HuangZ,DuanW,RenJ,LiuT,LiY,HouX.Genome-wideanalysisofthebHLHtranscriptionfactorfamilyinChinesecabbage(Brassicarapassp.pekinensis).Moleculargeneticsandgenomics2014,289(1):77-91. 11.SongX,LiuT,DuanW,MaQ,RenJ,WangZ,LiY,HouX.Genome-wideanalysisoftheGRASgenefamilyinChinesecabbage(Brassicarapassp.pekinensis).Genomics2014,103(1):135-146. 12.SongX,LiuG,DuanW,LiuT,HuangZ,RenJ,LiY,HouX.Genome-wideidentification,classificationandexpressionanalysisoftheheatshocktranscriptionfactorfamilyinChinesecabbage.Moleculargeneticsandgenomics2014,289(4):541-551. 13.LiuT,SongX,DuanW,HuangZ,LiuG,LiY,HouX.Genome-WideAnalysisandExpressionPatternsofNACTranscriptionFactorFamilyUnderDifferentDevelopmentalStagesandAbioticStressesinChineseCabbage.PlantMolBiolRep2014,32(5):1041-1056.(Co-firstauthor) 14.SongX,LiY,HouX.Genome-wideanalysisoftheAP2/ERFtranscriptionfactorsuperfamilyinChinesecabbage(Brassicarapassp.pekinensis).BMCgenomics2013,14:573.